Lien Vers Pubmed – 15461426

j. Mol. Evol. 2004 Jun; 58 (6): 692-700

CPG Dinucleotide deficiência foi encontrado em vírus, mitocôndrias, procariotas e eucariotas. A explicação consensual é que se deve à desaminação de citosinas metiladas, conforme estabelecido para vertebrados e plantas. No entanto, ainda não sabemos se a metilação da citosina C5 também é a principal causa de deficiência de CPG em bactérias. Combinando anotação e dados experimentais que identificam a presença de citosina C5 Metiltransferases com análise da abundância relativa do CPG em 67 espécies bacterianas, descobrimos que a abundância relativa da CPG na maioria dos genomas bacterianos que têm citosina c5 metiltransferases tendem a ser na faixa normal (observada / esperada valores entre 0,82 e 1,21). Em contraste, muitas espécies bacterianas susceptíveis de ser a metilação citosina C5 mostraram deficiência de CPG. Além disso, quando compararam genomas uns com os outros, as abundâncias relativas do TPG e CPA foram independentes da abundância relativa do CPG. Isso contrastou com análises do intragenome, onde a abundância relativa do C3PG1 (os subscritos referem-se à posição de um nucleotídeo em um codão) ser geralmente correlacionado positivamente com abundâncias relativas T3G1 quando plotada contra o conteúdo GC em seqüências de codificação de proteína (CDSs). Isso sugere a existência de mecanismos alternativos que contribuem para a deficiência de CPG em bactérias.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15461426

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